infos.ro

Testul genetic pentru cancer este mai puțin precis pentru persoanele de culoare și asiatice

Autor:, www.newscientist.com

Conștientizarea cancerului pulmonar - adenocarcinom: Terapiile care vizează modificări genetice specifice, cum ar fi EGFR, ALK și ROS1 sunt adecvate pentru cazurile selectate (încărcate de un patolog chirurgical din SUA);  ID Shutterstock 404835070;  comandă de achiziție: -;  loc de munca: -;  client: -;  alte: -

Evaluarea numărului de mutații genetice în tumori, cum ar fi celulele canceroase pulmonare (în imagine) poate ghida deciziile de tratament

Shutterstock / David A Litman

Testele genetice care prezic eficacitatea anumitor tratamente pentru cancer nu sunt la fel de eficiente pentru persoanele de ascendență africană sau asiatică.

Aceste teste măsoară numărul de mutații genetice în tumorile solide sau ceea ce se numește sarcina mutațională a tumorii (TMB). Dacă cineva are o tumoare cu 10 sau mai multe mutații genetice, are un TMB ridicat. Medicamente numite imune inhibitori ai punctelor de controlcare funcționează prin întoarcerea sistemului imunitar împotriva tumorilor, s-a dovedit a fi destul de eficace împotriva cancerelor la persoanele cu TMB ridicat, dar mai puțin la persoanele cu mai puține mutații.

Cea mai precisă modalitate de a măsura TMB este efectuarea de analize genetice atât a probelor de tumoră, cât și de țesut normal. Aceasta se numește secvențierea normală a tumorii și asigură că mutațiile inerente de la părinții lor nu sunt considerate mutații tumorale. „Dacă nu aveți țesut normal potrivit de la un individ, puteți supraestima de fapt povara mutațională a tumorii”, spune Amin Nassar la Universitatea Yale din Connecticut.

Majoritatea centrelor de tratament utilizează în prezent secvențierea genetică numai pentru tumori, care estimează TMB prin compararea rezultatelor cu bazele de date genetice în loc de țesutul propriu al unei persoane. Acest lucru economisește timp și bani, dar marea majoritate a informațiilor genetice din aceste baze de date provin de la oameni albi de origine europeanăceea ce înseamnă că aceste comparații pot duce la mai multe clasificări greșite TMB în rândul persoanelor de origine asiatică sau africană.

Pentru a determina cât de comun este acest lucru, Nassar și colegii săi au colectat date despre 3618 de persoane din Programul de Atlas al Genomului Cancerului al Institutului Național al Cancerului care au avut cancere care ar putea fi tratate cu inhibitori ai punctelor de control imunitare. Cercetătorii au folosit teste genetice, mai degrabă decât rasa auto-raportată, pentru a determina că 582 de persoane erau de origine non-europeană. Deoarece probele de tumoră și țesut normal au fost disponibile pentru toți participanții, cercetătorii au estimat TMB atât cu secvențierea numai pentru tumori, cât și cu cea normală a tumorii.

Ei au descoperit că, în medie, secvențierea doar tumorii a dublat TMB la persoanele de origine non-europeană, comparativ cu secvențierea normală a tumorii. Pentru persoanele cu ascendență europeană, secvențierea numai tumorii a crescut TMB de 1,5 ori.

Folosind aceste date, cercetătorii au dezvoltat o formulă simplă pentru a recalibra rezultatele de secvențiere numai pentru tumori, care ține cont de ascendența, tipul de cancer și supraestimările TMB. Ei au testat apoi formula pe un grup de 456 de pacienți care au suferit atât secvențierea tumorii, cât și tumorile normale și au descoperit că a redus supraestimările TMB în rezultatele secvențierii numai tumorii. Când a fost testată pe 2800 de persoane tratate pentru cancer la Institutul de Cancer Dana-Farber din Boston, formula a arătat că 43,6% dintre cei cu ascendență africană, 37% dintre cei cu ascendență asiatică și 21% dintre cei cu ascendență europeană fuseseră clasificate greșit de secvențierea numai tumorii ca având TMB ridicat.

„Dacă clasificăm greșit mai mulți negri și asiatici ca având TMB ridicat, atunci este mai probabil să le oferim [immune checkpoint inhibitors]”, spune Nassar. Aceste medicamente nu numai că sunt ineficiente asupra tumorilor cu TMB scăzut, dar pot provoca și reacții adverse grave, cum ar fi diabet, miocardită și dificultăți de respirațieel spune.

În plus, chiar și scorurile TMB precise pot să nu fie la fel de utile pentru a ghida deciziile de tratament pentru persoanele care sunt de culoare sau asiatice. Ca parte a acestei lucrări, cercetătorii au analizat, de asemenea, o cohortă separată de 879 de persoane tratate la Institutul de Cancer Dana-Farber pentru cancer pulmonar fără celule mici. În acel grup, 758 de persoane aveau ascendență europeană, 64 aveau ascendență africană și 57 aveau ascendență asiatică. Toți au avut TMB ridicat în funcție de secvențierea numai tumorii și au fost tratați cu inhibitori ai punctelor de control imunitare.

Algoritmul a reclasificat 569 de persoane ca având TMB scăzut. Cercetatorii au analizat apoi rezultatele tratamentului pe grupe rasiale si au recalibrat scorurile TMB. Ei au descoperit că, după 36 de luni de inhibitori ai punctelor de control, rata generală de supraviețuire pentru persoanele de origine europeană cu TMB ridicat a fost de 42%, comparativ cu 22% la cei cu TMB scăzut.

„În populațiile albe, știm că TMB ridicat se corelează cu un rezultat mai bun” după tratamentul cu inhibitori ai punctelor de control, spune Nassar. Dar „pentru negrii și asiatici, acesta nu a fost de fapt cazul”.

Cercetătorii au descoperit că persoanele de origine non-europeană care au avut scoruri TMB ridicate au avut rate de supraviețuire mai scăzute după tratamentul cu inhibitori ai punctelor de control decât cei cu scoruri scăzute ale TMB. La persoanele de culoare, ratele de supraviețuire au fost de 26 și, respectiv, de 31% pentru scorurile ridicate și, respectiv, scăzute. Pentru persoanele cu ascendență asiatică, acestea au fost de 12 și 29 la sută.

Această disparitate s-ar putea datora inechităților în domeniul sănătății, lipsei de diversitate rasială în studiile clinice sau limitărilor studiului, cum ar fi o dimensiune mică a eșantionului, spune Nassar. „Povara mutațională a tumorii nu se extrapolează la non-albi”, spune el.

Pentru a trata mai bine cancerele la persoanele de culoare și asiatice, trebuie mai întâi să înțelegem de ce este acest lucru și ce alte măsuri ar putea fi necesare în schimb. Aceasta înseamnă creșterea diversității în toate etapele procesului de dezvoltare a medicamentelor, inclusiv a numărului de participanți de culoare și asiatici la studiile clinice, spune Nassar. Pe termen scurt, totuși, este esențial ca medicii să fie conștienți de aceste părtiniri atunci când iau decizii de tratament bazate pe TMB, spune el.

Referința jurnalului: Celula canceroasă, DOI: 10.1016/j.ccell.2022.08.022

Mai multe despre aceste subiecte:

You might also like